MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Meiothermus ruber DSM 1279 genome

Total Repeats: 68571

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2502	NC_021081	GCCCT	2	10	112791	112800	0 %	20 %	20 %	60 %	482881761
2503	NC_021081	TGC	2	6	112813	112818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881761
2504	NC_021081	TGG	2	6	112837	112842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881761
2505	NC_021081	TGG	2	6	112861	112866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881761
2506	NC_021081	GTG	2	6	112869	112874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881761
2507	NC_021081	CAC	2	6	112880	112885	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881761
2508	NC_021081	GGCCT	2	10	112887	112896	0 %	20 %	40 %	40 %	482881761
2509	NC_021081	GCC	2	6	113029	113034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881761
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2513	NC_021081	TGG	3	9	113098	113106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881761
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2517	NC_021081	GCT	2	6	113369	113374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881761
2518	NC_021081	CTGGC	2	10	113382	113391	0 %	20 %	40 %	40 %	482881761
2519	NC_021081	AGCTCG	2	12	113479	113490	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	482881761
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2521	NC_021081	TGC	2	6	113515	113520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881761
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2553	NC_021081	TGG	2	6	114396	114401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881761
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2601	NC_021081	CCA	2	6	116694	116699	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881763
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2603	NC_021081	TCG	2	6	116726	116731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881763
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2622	NC_021081	ATA	2	6	117731	117736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2623	NC_021081	AAT	2	6	117763	117768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2732	NC_021081	GGTTG	2	10	122096	122105	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
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2746	NC_021081	G	6	6	122905	122910	0 %	0 %	100 %	0 %	482881768
2747	NC_021081	GGC	2	6	122957	122962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881768
2748	NC_021081	GC	3	6	122981	122986	0 %	0 %	50 %	50 %	482881768
2749	NC_021081	GCC	2	6	123005	123010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881768
2750	NC_021081	CAT	2	6	123064	123069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482881768
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2753	NC_021081	G	6	6	123217	123222	0 %	0 %	100 %	0 %	482881768
2754	NC_021081	AGC	2	6	123250	123255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881768
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2758	NC_021081	CGG	2	6	123564	123569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881768
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2760	NC_021081	CCCTA	2	10	123607	123616	20 %	20 %	0 %	60 %	482881768
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2766	NC_021081	CTGGG	2	10	123956	123965	0 %	20 %	60 %	20 %	482881768
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2769	NC_021081	CGA	2	6	124030	124035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881768
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2771	NC_021081	GCT	2	6	124174	124179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881768
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2773	NC_021081	CCG	2	6	124303	124308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881768
2774	NC_021081	AGC	2	6	124340	124345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881768
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2778	NC_021081	AAG	2	6	124601	124606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482881769
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2781	NC_021081	GGGCAG	2	12	124658	124669	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	482881769
2782	NC_021081	ACT	2	6	124698	124703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482881769
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2784	NC_021081	G	6	6	124829	124834	0 %	0 %	100 %	0 %	482881769
2785	NC_021081	CGC	2	6	124927	124932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881769
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2792	NC_021081	AAAG	2	8	125417	125424	75 %	0 %	25 %	0 %	482881770
2793	NC_021081	CCGC	2	8	125439	125446	0 %	0 %	25 %	75 %	482881770
2794	NC_021081	GGC	2	6	125447	125452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881770
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2799	NC_021081	CGG	2	6	125587	125592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881770
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2806	NC_021081	GCCCC	2	10	125907	125916	0 %	0 %	20 %	80 %	482881771
2807	NC_021081	GGA	2	6	125937	125942	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482881771
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2821	NC_021081	CTG	2	6	126517	126522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881771
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2825	NC_021081	CTG	2	6	126846	126851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881772
2826	NC_021081	GCG	2	6	126872	126877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881772
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2828	NC_021081	CGC	2	6	126926	126931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881772
2829	NC_021081	ACCG	2	8	127182	127189	25 %	0 %	25 %	50 %	482881772
2830	NC_021081	CTG	2	6	127257	127262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881772
2831	NC_021081	GATG	2	8	127298	127305	25 %	25 %	50 %	0 %	482881772
2832	NC_021081	GCA	2	6	127333	127338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881772
2833	NC_021081	TAC	2	6	127452	127457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482881772
2834	NC_021081	GAG	2	6	127632	127637	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482881772
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2836	NC_021081	T	6	6	127742	127747	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2837	NC_021081	GAA	2	6	127807	127812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482881773
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2840	NC_021081	CTG	2	6	128196	128201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881774
2841	NC_021081	GGT	2	6	128231	128236	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881774
2842	NC_021081	CCG	2	6	128279	128284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881774
2843	NC_021081	GCC	2	6	128296	128301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881774
2844	NC_021081	CGA	2	6	128381	128386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881774
2845	NC_021081	GACC	2	8	128396	128403	25 %	0 %	25 %	50 %	482881774
2846	NC_021081	CCCCGA	2	12	128452	128463	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	482881775
2847	NC_021081	GTG	2	6	128569	128574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881775
2848	NC_021081	T	6	6	128587	128592	0 %	100 %	0 %	0 %	482881775
2849	NC_021081	GGA	2	6	128593	128598	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482881775
2850	NC_021081	AGG	2	6	128661	128666	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482881775
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2852	NC_021081	TGC	2	6	128685	128690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881775
2853	NC_021081	AAG	2	6	128691	128696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482881775
2854	NC_021081	CCG	2	6	128791	128796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881775
2855	NC_021081	AGG	2	6	128889	128894	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482881775
2856	NC_021081	TGG	2	6	128919	128924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881775
2857	NC_021081	CACC	2	8	128941	128948	25 %	0 %	0 %	75 %	482881775
2858	NC_021081	G	6	6	128973	128978	0 %	0 %	100 %	0 %	482881775
2859	NC_021081	CTA	2	6	129001	129006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482881775
2860	NC_021081	AGCC	2	8	129016	129023	25 %	0 %	25 %	50 %	482881775
2861	NC_021081	CAA	2	6	129131	129136	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482881775
2862	NC_021081	AGG	2	6	129140	129145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482881775
2863	NC_021081	CAG	3	9	129318	129326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881776
2864	NC_021081	CA	3	6	129342	129347	50 %	0 %	0 %	50 %	482881776
2865	NC_021081	TTCGG	2	10	129377	129386	0 %	40 %	40 %	20 %	482881776
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2993	NC_021081	CTA	2	6	135304	135309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482881781
2994	NC_021081	TGG	2	6	135435	135440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881781
2995	NC_021081	AGA	2	6	135444	135449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482881781
2996	NC_021081	CCG	2	6	135453	135458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881781
2997	NC_021081	GCC	2	6	135482	135487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881781
2998	NC_021081	CTGG	2	8	135504	135511	0 %	25 %	50 %	25 %	482881781
2999	NC_021081	GGC	2	6	135520	135525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881781
3000	NC_021081	CAG	2	6	135560	135565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881781

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